El exauditor general de la República obtuvo las mayorías en el Congreso y se convirtió en la máxima cabeza del ente de control.
Con 203 votos de 248, el pereirano Carlos Felipe Córdoba se convirtió en el nuevo Contralor General de la República. Córdoba era el candidato de César Gaviria, Germán Vargas Lleras, Aurelio Iragorri y Andrés Pastrana, ya que contó con el apoyo del Partido Liberal, Cambio Radical, La U y el conservatismo.
La elección del Contralor fue el primer gran pulso político para el nuevo gobierno, el cual perdió producto de los apenas 18 votos obtenidos por José Félix Lafaurie, candidato del uribismo.
La votación definitva quedó de la siguiente manera: 248 votos depositados
Carlos Felipe Córdoba: 203
Julio César Cárdenas: 31
José Félix Lafaurie: 18
José Andrés O‘meara: 1
Votos en blanco: 1
